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预混or非预混,RNA建库试剂盒,你pick哪个呢?

作者:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 2023-10-20T00:00 (访问量:9286)

预混or非预混,RNA建库试剂盒,你pick哪个呢?

 

RNA测序,又称为转录组测序,是高通量测序中应用非常广泛的组学技术之一。其研究应用有:
  • 不同处理组差异基因表达分析;

     

  • mRNA表达量的差异研究;

     

  • mRNA结构上的差异(可变剪接、融合基因、点突变(SNP)。

 

RNA测序实验流程如下:
 
 
目前,翌圣生物RNA建库试剂盒不断进行升级,试剂盒越来越便捷,快速。

 

图.翌圣生物RNA建库试剂盒进化轴

 

目前,RNA建库试剂盒已经进化到预混版建库试剂盒,试剂组分已经完全简化,每步操作只加一次试剂即可进行PCR。
 
图.非预混和预混版建库试剂盒组分对比
 
预混版建库试剂盒,在操作上节省人力时间,而且单次样本越多,效果越明显。
 
 
 
 
本次对比的试剂盒为翌圣非预混版建库试剂盒(12308)和预混版建库试剂盒(12310)进行操作比对,实验室,使用8个样本进行mRNA建库。
 
图.实验对比(12308ES VS 12310ES)
 

 

#操作详解
 
01
1st cDNA合成

该步骤对片段化后的RNA进行逆转录,预混版RNA建库,只需要将1st模块试剂加入片段化后的RNA即可进行PCR,而非预混RNA建库试剂盒,需要分开添加1st逆转录酶和1st逆转录酶buffer。

02
2nd合成步骤

该步骤承接1st cDNA合成步骤进行二链互补链合成以及末修、加A等步骤。预混版RNA建库试剂盒,只需要将完成1st cDNA PCR步骤的试剂拿出,直接加入2nd 合成试剂即可进行下步PCR操作,而非预混RNA建库试剂盒,需要分开添加2nd合成buffer和酶。

03
接头连接步骤

该步骤承接2nd二链合成步骤,进行后续接头连接。预混版RNA建库试剂盒,只需要加入接头连接模块和接头,即可进行接头PCR过程,而非预混版RNA建库试剂盒,需要分开添加连接酶、连接buffer以及接头。

 

后续PCR扩增和文库分选、文库定量等步骤,操作流程类型,此处不再进行赘述。整体看来,预混版RNA建库试剂盒,不论是操作时间,还是操作的便捷度上,都有非常大的优势。尤其是在自动化建库时,这种便捷度,能大大提高自动化效率。
 
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